Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TPRNQ4KMQ1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TPRNQ4KMQ1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
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