Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PROX2Q3B8N5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms