Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC96Q2M329 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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