Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPE65Q16518 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPE65Q16518 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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