Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NPTX1Q15818 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms