Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SS18Q15532 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SS18Q15532 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SS18Q15532 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SS18Q15532 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SS18Q15532 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
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SS18Q15532 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SS18Q15532 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SS18Q15532 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
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SS18Q15532 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SS18Q15532 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SS18Q15532 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SS18Q15532 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SS18Q15532 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SS18Q15532 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SS18Q15532 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SS18Q15532 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SS18Q15532 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SS18Q15532 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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SS18Q15532 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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SS18Q15532 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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SS18Q15532 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SS18Q15532 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SS18Q15532 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SS18Q15532 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SS18Q15532 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SS18Q15532 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SS18Q15532 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SS18Q15532 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SS18Q15532 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SS18Q15532 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
SS18Q15532 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SS18Q15532 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
SS18Q15532 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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