Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COL9A3Q14050 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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COL9A3Q14050 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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COL9A3Q14050 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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