Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK13Q14004 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK13Q14004 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
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