Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms