Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA9Q13797 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ITGA9Q13797 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms