Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RUNX3Q13761 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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