Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MTMR3Q13615 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MTMR3Q13615 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms