Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TCIRG1Q13488 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms