Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SMAD4Q13485 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
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