Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IKZF1Q13422 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms