Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PMS2P3Q13401 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PMS2P3Q13401 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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