Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLF1Q13351 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLF1Q13351 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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