Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SKP2Q13309 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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