Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PTGDRQ13258 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PTGDRQ13258 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PTGDRQ13258 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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PTGDRQ13258 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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PTGDRQ13258 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTGDRQ13258 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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