Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GRIN2BQ13224 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GRIN2BQ13224 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
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