Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAF1Q13077 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms