Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PRDM2Q13029 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PRDM2Q13029 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
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