Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GRIN2AQ12879 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
GRIN2AQ12879 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
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