Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CNTN1Q12860 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CNTN1Q12860 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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