Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC15Q0P6D6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC15Q0P6D6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms