Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
IFFO1Q0D2I5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
IFFO1Q0D2I5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms