Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LOXL1Q08397 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms