Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
COL16A1Q07092 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COL16A1Q07092 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms