Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF11Q05519 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms