Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1BQ00975 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms