Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ACTA1P68133 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms