Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VBP1P61758 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VBP1P61758 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VBP1P61758 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VBP1P61758 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms