Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTBP2P56545 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms