Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EFNA4P52798 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms