Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NUP153P49790 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP153P49790 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP153P49790 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP153P49790 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP153P49790 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP153P49790 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP153P49790 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP153P49790 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP153P49790 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP153P49790 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP153P49790 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP153P49790 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP153P49790 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP153P49790 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NUP153P49790 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP153P49790 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP153P49790 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP153P49790 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP153P49790 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP153P49790 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP153P49790 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP153P49790 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP153P49790 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP153P49790 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP153P49790 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP153P49790 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP153P49790 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP153P49790 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NUP153P49790 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP153P49790 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP153P49790 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP153P49790 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP153P49790 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP153P49790 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP153P49790 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP153P49790 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP153P49790 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP153P49790 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP153P49790 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP153P49790 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP153P49790 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP153P49790 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP153P49790 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP153P49790 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP153P49790 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP153P49790 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP153P49790 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NUP153P49790 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP153P49790 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP153P49790 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP153P49790 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP153P49790 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP153P49790 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP153P49790 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP153P49790 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP153P49790 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP153P49790 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NUP153P49790 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP153P49790 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP153P49790 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP153P49790 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP153P49790 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP153P49790 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP153P49790 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP153P49790 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP153P49790 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP153P49790 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP153P49790 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP153P49790 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP153P49790 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP153P49790 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP153P49790 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP153P49790 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP153P49790 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP153P49790 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NUP153P49790 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP153P49790 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP153P49790 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP153P49790 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP153P49790 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP153P49790 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP153P49790 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP153P49790 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP153P49790 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP153P49790 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP153P49790 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP153P49790 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP153P49790 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP153P49790 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP153P49790 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NUP153P49790 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NUP153P49790 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NUP153P49790 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NUP153P49790 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUP153P49790 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUP153P49790 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NUP153P49790 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NUP153P49790 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NUP153P49790 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms