Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC6A9P48067 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms