Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXD12P35452 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXD12P35452 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms