Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHRNA5P30532 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms