Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PEX2P28328 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX2P28328 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX2P28328 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX2P28328 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX2P28328 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX2P28328 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX2P28328 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX2P28328 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX2P28328 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX2P28328 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX2P28328 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX2P28328 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX2P28328 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX2P28328 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX2P28328 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX2P28328 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX2P28328 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX2P28328 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX2P28328 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX2P28328 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PEX2P28328 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PEX2P28328 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms