Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-DMAP28067 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-DMAP28067 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms