Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRAP18433 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRAP18433 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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