Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms