Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DSPP15924 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DSPP15924 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DSPP15924 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
DSPP15924 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
DSPP15924 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DSPP15924 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSPP15924 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSPP15924 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSPP15924 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSPP15924 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSPP15924 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSPP15924 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSPP15924 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSPP15924 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSPP15924 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DSPP15924 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSPP15924 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSPP15924 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DSPP15924 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms