Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DEFA4P12838 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms