Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C4AP0C0L4 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C4AP0C0L4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms