Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HSP90AB1P08238 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms