Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD3O95983 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD3O95983 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD3O95983 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MBD3O95983 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD3O95983 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD3O95983 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD3O95983 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD3O95983 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD3O95983 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD3O95983 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD3O95983 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD3O95983 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MBD3O95983 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD3O95983 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MBD3O95983 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MBD3O95983 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3O95983 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3O95983 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3O95983 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3O95983 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3O95983 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3O95983 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3O95983 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3O95983 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MBD3O95983 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3O95983 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3O95983 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3O95983 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3O95983 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3O95983 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3O95983 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3O95983 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3O95983 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3O95983 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MBD3O95983 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms