Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIX6O95475 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIX6O95475 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIX6O95475 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SIX6O95475 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms