Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL3O95236 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL3O95236 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL3O95236 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL3O95236 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL3O95236 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL3O95236 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL3O95236 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL3O95236 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL3O95236 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOL3O95236 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOL3O95236 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOL3O95236 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOL3O95236 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOL3O95236 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOL3O95236 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOL3O95236 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOL3O95236 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOL3O95236 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOL3O95236 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOL3O95236 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOL3O95236 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOL3O95236 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOL3O95236 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOL3O95236 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOL3O95236 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOL3O95236 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOL3O95236 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOL3O95236 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOL3O95236 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOL3O95236 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOL3O95236 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms