Protein–RNA interactions for Protein: O60449

LY75, Lymphocyte antigen 75, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY75O60449 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY75O60449 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY75O60449 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY75O60449 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY75O60449 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY75O60449 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY75O60449 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY75O60449 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY75O60449 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LY75O60449 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY75O60449 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY75O60449 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY75O60449 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY75O60449 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY75O60449 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY75O60449 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LY75O60449 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY75O60449 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY75O60449 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY75O60449 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY75O60449 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LY75O60449 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LY75O60449 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY75O60449 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY75O60449 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY75O60449 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY75O60449 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY75O60449 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY75O60449 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY75O60449 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY75O60449 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY75O60449 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY75O60449 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY75O60449 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY75O60449 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY75O60449 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY75O60449 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY75O60449 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY75O60449 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY75O60449 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY75O60449 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY75O60449 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY75O60449 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY75O60449 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY75O60449 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY75O60449 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY75O60449 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY75O60449 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY75O60449 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LY75O60449 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY75O60449 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY75O60449 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY75O60449 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY75O60449 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY75O60449 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LY75O60449 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY75O60449 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY75O60449 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LY75O60449 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY75O60449 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LY75O60449 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY75O60449 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY75O60449 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY75O60449 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY75O60449 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY75O60449 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY75O60449 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY75O60449 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY75O60449 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LY75O60449 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY75O60449 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY75O60449 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY75O60449 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LY75O60449 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms